青、白礁慈济宫一直被分炉于闽、粤、台广大地域数以百计的、不同名称的保生大帝宫庙奉为祖庙。据初步统计，福建省厦、漳、泉三市祀奉保生大帝的庙宇皆有上百座。在台湾的400余座保生大帝庙, 其中分别认青、白礁慈济宫为祖庙都是自明末清初以来分炉过台湾的。青礁慈济宫于上世纪末前后得到台中市元保宫捐资重修，已废的龙湫庵也由屏东县海埔万寿宫捐款重建。祀奉信仰保生大帝，被海峡两岸信徒称为“慈济精神”，据称台湾信仰保生大帝者数以千万计，神缘广泛，影响深远，被视为两岸宗教文化交流，联系乡亲情意的金桥和纽带。