在闽南，清明节是比较盛大的节日之一，主要活动是祭祖和扫墓。不同的是，这两种活动有些地方在同一天进行，如泉州、厦门等地的闽南人常通在清明节的中午准备五味筵碗和润饼（或称“簿饼”、“春饼”）的菜肴等祭品，在神庙、祠堂和家中祭祀神灵、祖先、厝主、地基主、门口公等，午餐后，除老人、病人、幼儿，其他人都去参加扫墓；而漳州等的习俗是清明节扫墓，农历三月初三的上巳节即寒食节才祭祖。

扫墓时，一般一门祖坟都需要备办两份供口与纸钱，一份祭拜坟地的后土之神或土地公，一份祭祀祖先。到墓地后，先清理坟墓四周的杂草，把墓园内外整理干净，给墓碑上的字重新上色。然后，先在后土或土地公的神位前摆放祭品，点烛、烧香、烧金祭祀。接着才祭拜祖先，并在坟墓的墓碑、墓龟、墓围各处压上五叠或散压俗称“墓纸”的五色长纸钱，待一炷香烧完，表示祖先已享用好供品，才在坟前烧些俗称“金纸”或“大银”、“小银”的纸钱给祖先在阴间使用，最后，放鞭炮表示扫墓结束。

在宗族组织比较严密的地方，墓祭通常是从开基祖的祖坟依次往下祭祀。在祭扫本宗族前几代祖先的祖墓时，有的宗族也会使用祭文。本宗族的人集体从事墓祭结束时，会在墓地上分食祭品，有的则将供品分发给周围的人，以示祖先德泽永在。